2010年秋,世卫组织官员小林荣子随队前往菲律宾扑灭禽流感,疫情很快得以控制,但仍有感染者私自离开疫区……次年,东京都的某家市立医院,医生松冈刚收治的一名高烧病人入院后情况急转直下,咳血而死,病人家属与部分医生亦因感染而病倒。同时,近郊一家养 鸡场内检测出禽流感病毒,场主神苍及女儿的平静生活被打破。
小林荣子受命至此指导防疫,旧相识松冈担任其助手。疫情迅速扩散,一月之内病亡人数达到两千,各地出现恐慌,引发国际关注,政府迅速将疫区封锁。松冈偶然之下得知病毒源头可能另有所在,国外传回的检测结果支持了他的判断,松冈决定远赴国外查找病源。在空前的疫情中,松冈、小林以及神苍每个人都将面临自己选择的考验。